Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX2Q9UBZ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms