Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV2

SEL1L, Protein sel-1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1LQ9UBV2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEL1LQ9UBV2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEL1LQ9UBV2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEL1LQ9UBV2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms