Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPASTQ9UBP0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPASTQ9UBP0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms