Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN10Q9UBB4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms