Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHPF2Q9P2E5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHPF2Q9P2E5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHPF2Q9P2E5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms