Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNIP2Q9P278 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNIP2Q9P278 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms