Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HCN3Q9P1Z3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HCN3Q9P1Z3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms