Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD3Q9P035 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD3Q9P035 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms