Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 MGAT1-223ENST00000514283 619 ntTSL 221.76■■□□□ 1.075e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.025e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 CCNE1-205ENST00000575243 820 ntTSL 521.22■□□□□ 0.994e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.965e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.945e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-205ENST00000446511 371 ntTSL 519.34■□□□□ 0.695e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 LARGE1-210ENST00000434071 562 ntTSL 419.3■□□□□ 0.685e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 MGAT1-206ENST00000502678 693 ntTSL 419.11■□□□□ 0.655e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 MGAT1-209ENST00000505682 534 ntTSL 319.08■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.595e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 LARGE1-213ENST00000494763 537 ntTSL 418.6■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.56e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.445e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 SH3BP5L-203ENST00000484202 3110 ntTSL 217.77■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 GRIN2C-204ENST00000584176 6516 ntTSL 217.48■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-212ENST00000498030 463 ntTSL 217.48■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 MGAT1-220ENST00000512695 549 ntTSL 417.26■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 MGAT1-208ENST00000504671 878 ntTSL 317.26■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 LARGE1-204ENST00000413114 773 ntTSL 417.04■□□□□ 0.325e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 SLC4A2-206ENST00000466368 548 ntTSL 416.81■□□□□ 0.285e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 MGAT1-211ENST00000506269 564 ntTSL 416.65■□□□□ 0.265e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 ADORA2A-202ENST00000424232 569 ntTSL 416.63■□□□□ 0.255e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 RHOC-219ENST00000534717 574 ntTSL 315.98■□□□□ 0.155e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 SH3BP5L-202ENST00000475978 4122 ntTSL 215.27■□□□□ 0.045e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-207ENST00000468536 817 ntTSL 215.26■□□□□ 0.035e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 BLOC1S2-201ENST00000361832 425 ntTSL 515.25■□□□□ 0.035e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 06e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.075e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-209ENST00000477370 756 ntTSL 314.15□□□□□ -0.145e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.154e-15■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-204ENST00000446403 702 ntTSL 314.1□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 RHOC-209ENST00000414971 470 ntTSL 313.99□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.254e-15■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 513.38□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.285e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 MGAT1-207ENST00000504385 540 ntTSL 412.4□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 AHI1-215ENST00000531788 3655 ntTSL 212.33□□□□□ -0.444e-15■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 212.07□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 DAXX-206ENST00000453407 801 ntTSL 511.47□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 ADORA2A-207ENST00000467385 549 ntTSL 411.32□□□□□ -0.65e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 ANKRD36C-204ENST00000528268 1907 ntTSL 29.34□□□□□ -0.915e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.194e-15■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 AHI1-206ENST00000475846 2920 ntTSL 26.92□□□□□ -1.34e-15■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.735e-8■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 AHI1-203ENST00000367799 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)3.52□□□□□ -1.854e-15■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 PRELID3A-207ENST00000589952 488 ntTSL 417.78■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 PRELID3A-206ENST00000589565 777 ntTSL 317.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 PRELID3A-205ENST00000588729 529 ntTSL 417.19■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 PRELID3A-204ENST00000587862 580 ntTSL 516.89■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 ADAP1-212ENST00000481406 395 ntTSL 221.17■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-13■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 218.99■□□□□ 0.631e-13■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 518.29■□□□□ 0.521e-13■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.511e-13■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 217.54■□□□□ 0.41e-13■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 217.12■□□□□ 0.331e-13■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 RAI1-204ENST00000489697 1570 ntTSL 316.68■□□□□ 0.264e-9■■■■■ 27.9
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-208ENST00000450000 574 ntTSL 424■■□□□ 1.438e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-209ENST00000463244 545 ntTSL 423.07■■□□□ 1.288e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-204ENST00000413232 727 ntTSL 321.1■□□□□ 0.978e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-225ENST00000545934 565 ntTSL 418.56■□□□□ 0.568e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.28e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.118e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.068e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 513.74□□□□□ -0.218e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 513.13□□□□□ -0.318e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 513□□□□□ -0.338e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-217ENST00000537162 801 ntTSL 311.02□□□□□ -0.658e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 38.81□□□□□ -18e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-216ENST00000536548 598 ntTSL 48.39□□□□□ -1.078e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 26.71□□□□□ -1.348e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 56.71□□□□□ -1.348e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-210ENST00000474684 635 ntTSL 36.44□□□□□ -1.388e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.438e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.243e-9■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.689e-7■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 SLC9A1-201ENST00000263980 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 27.8
FAM120AQ9NZB2 ULK1-202ENST00000537421 959 ntTSL 313.45□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 27.7
FAM120AQ9NZB2 FKBP9-207ENST00000471066 591 ntTSL 410.78□□□□□ -0.683e-14■■■■■ 27.7
FAM120AQ9NZB2 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 27.7
FAM120AQ9NZB2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.695e-11■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 116.3 ms