Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRN3Q9NYV6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRN3Q9NYV6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRN3Q9NYV6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms