Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS1Q9NYS0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms