Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VNN3Q9NY84 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms