Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA8Q9NY65 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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