Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A12Q9NXJ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A12Q9NXJ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms