Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD4Q9NXE4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD4Q9NXE4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPD4Q9NXE4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms