Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM6Q9NX76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM6Q9NX76 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms