Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB20Q9NX57 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB20Q9NX57 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms