Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COMMD8Q9NX08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COMMD8Q9NX08 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD8Q9NX08 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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