Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OXSMQ9NWU1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OXSMQ9NWU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms