Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SAMSN1Q9NSI8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMSN1Q9NSI8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms