Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE4

IARS2, Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IARS2Q9NSE4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IARS2Q9NSE4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IARS2Q9NSE4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IARS2Q9NSE4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms