Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms