Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHPT1Q9NRX4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHPT1Q9NRX4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms