Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD2Q9NRG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMYD2Q9NRG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms