Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX9Q9NQ69 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX9Q9NQ69 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX9Q9NQ69 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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