Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK9Q9NPC2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK9Q9NPC2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms