Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUFT1Q9NNX1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms