Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRMS1Q9HCU9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRMS1Q9HCU9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms