Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNRC6CQ9HCJ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms