Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP29Q9HBJ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms