Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LY9Q9HBG7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LY9Q9HBG7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LY9Q9HBG7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms