Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKRIP1Q9H875 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PRKRIP1Q9H875 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRKRIP1Q9H875 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms