Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf42Q9H799 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf42Q9H799 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms