Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR55Q9H6Y2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR55Q9H6Y2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms