Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STN1Q9H668 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STN1Q9H668 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STN1Q9H668 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms