Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDCL3Q9H2J4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCL3Q9H2J4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms