Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC113Q9H0I3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC113Q9H0I3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC113Q9H0I3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms