Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASXL3Q9C0F0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ASXL3Q9C0F0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms