Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4CQ9C0C4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4CQ9C0C4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms