Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.746e-7■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.676e-7■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.676e-7■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.423e-11■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.143e-11■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-11■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-11■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 314.18□□□□□ -0.143e-11■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 MLLT10-211ENST00000471315 319 ntTSL 313.27□□□□□ -0.293e-11■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.223e-11■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 218.38■□□□□ 0.539e-7■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.89e-7■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 SAP30-202ENST00000504618 410 ntTSL 318.63■□□□□ 0.579e-7■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-29■■□□□ 13.8
FTOQ9C0B1 CCNG2-203ENST00000497512 2051 ntTSL 1 (best)31.35■■■□□ 2.618e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.778e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.588e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.11e-11■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-206ENST00000417435 970 ntTSL 520.08■□□□□ 0.818e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.748e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.668e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 TMCC1-212ENST00000512902 533 ntTSL 318.94■□□□□ 0.628e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 TMCC1-214ENST00000515024 557 ntTSL 318.52■□□□□ 0.568e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 PIGC-205ENST00000478184 744 ntTSL 318.05■□□□□ 0.488e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.38e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-218ENST00000494170 969 ntTSL 316.9■□□□□ 0.38e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-211ENST00000471821 558 ntTSL 216.79■□□□□ 0.288e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 PIGC-206ENST00000484368 1661 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.258e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.238e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-212ENST00000475943 860 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.218e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 UQCRC1-208ENST00000472438 477 ntTSL 216.16■□□□□ 0.185e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.148e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-207ENST00000428488 581 ntTSL 315.47■□□□□ 0.078e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-209ENST00000453245 729 ntTSL 515.47■□□□□ 0.078e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-201ENST00000369531 519 ntTSL 314.29□□□□□ -0.128e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 514.27□□□□□ -0.128e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 TMCC1-205ENST00000505616 402 ntTSL 211.74□□□□□ -0.538e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MPP1-203ENST00000393529 794 ntTSL 59.83□□□□□ -0.848e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.888e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 TMCC1-206ENST00000505924 665 ntTSL 56.6□□□□□ -1.358e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 TMCC1-208ENST00000508869 467 ntTSL 34.19□□□□□ -1.748e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 216.2■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.49e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 COL27A1-202ENST00000451716 2865 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-207ENST00000502487 1346 ntTSL 1 (best)30■■■□□ 2.398e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.158e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-211ENST00000513545 775 ntTSL 325.11■■□□□ 1.618e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-209ENST00000506183 383 ntTSL 1 (best)19.52■□□□□ 0.728e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.728e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.648e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-204ENST00000356483 677 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.628e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.628e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-212ENST00000515540 300 ntTSL 317.34■□□□□ 0.378e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.288e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.158e-10■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 528.81■■■□□ 2.24e-6■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 220.26■□□□□ 0.835e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 FLNA-209ENST00000444578 843 ntTSL 319.57■□□□□ 0.725e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 317.45■□□□□ 0.384e-6■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 FLNA-217ENST00000498411 368 ntTSL 317.44■□□□□ 0.385e-8■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.383e-7■■□□□ 13.7
FTOQ9C0B1 MORF4L1-214ENST00000559258 1047 ntTSL 26.3□□□□□ -1.42e-9■■□□□ 13.6
FTOQ9C0B1 ST3GAL2-203ENST00000561708 581 ntTSL 419.58■□□□□ 0.724e-10■■□□□ 13.6
FTOQ9C0B1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.074e-9■■□□□ 13.6
FTOQ9C0B1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.074e-9■■□□□ 13.6
FTOQ9C0B1 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 520.73■□□□□ 0.914e-11■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.42□□□□□ -1.224e-21■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.731e-13■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.91e-13■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-13■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.345e-6■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.745e-6■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.75e-6■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 MRFAP1-204ENST00000512914 1982 nt18.92■□□□□ 0.625e-6■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.325e-6■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.913e-6■■□□□ 13.5
FTOQ9C0B1 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.156e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 RETREG2-207ENST00000452293 609 ntTSL 429.65■■■□□ 2.344e-13■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 RETREG2-201ENST00000273048 2533 ntTSL 1 (best)28.01■■■□□ 2.084e-13■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.194e-13■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.084e-13■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 RETREG2-205ENST00000443757 558 ntTSL 417.45■□□□□ 0.384e-13■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 RETREG2-208ENST00000458520 992 ntTSL 314.13□□□□□ -0.154e-13■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 NEDD8-207ENST00000533242 2300 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.891e-6■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.57e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 758 ntTSL 518.4■□□□□ 0.547e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 NEDD8-204ENST00000526430 286 ntTSL 312.83□□□□□ -0.367e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.427e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 NEDD8-202ENST00000396828 626 ntTSL 211.99□□□□□ -0.497e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 NEDD8-206ENST00000531430 651 ntTSL 210.99□□□□□ -0.657e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.057e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.85e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.415e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 UBE2T-203ENST00000487227 885 ntTSL 315.68■□□□□ 0.15e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.055e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.315e-7■■□□□ 13.4
FTOQ9C0B1 BNIP3L-207ENST00000523949 875 ntTSL 311.13□□□□□ -0.635e-7■■□□□ 13.4
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