Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM4Q9C037 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM4Q9C037 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms