Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM7Q9C029 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM7Q9C029 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM7Q9C029 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms