Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM15Q9C019 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM15Q9C019 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms