Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BARHL1Q9BZE3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BARHL1Q9BZE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BARHL1Q9BZE3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BARHL1Q9BZE3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BARHL1Q9BZE3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BARHL1Q9BZE3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms