Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM55Q9BYV6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms