Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDHR2Q9BYE9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDHR2Q9BYE9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR2Q9BYE9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms