Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SCAPERQ9BY12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAPERQ9BY12 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAPERQ9BY12 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms