Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MAP1LC3CQ9BXW4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms