Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1QTNF3Q9BXJ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms