Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM208Q9BTX3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms